Amostra: qualquer material biológico (secreções, abscessos, urina, fezes, biopsia aspirativa, sangue, biopsia tecidual, lavado traqueal…).

Recipiente:1. Amostras coletadas em swab estéril podem ser acondicionadas em tubo contendo meio de transporte adequado (ex. Meio de Stuart).
2. Amostras líquidas podem ser enviadas em seringa, coletor universal ou tubos sem anticoagulante/ativador de coágulo (obrigatoriamente recipiente estéril).
3. Biopsias teciduais ou fezes, em frasco coletor universal estéril, sem formol.
4. Amostra para hemocultura ou cultura anaeróbica em frasco/tubo com meio específico. Solicitar ao laboratório antes da coleta.

Conservação: a conservação pode variar, de acordo com a bactéria presente na amostra. Em geral, amostras líquidas ou sem meios conservantes refrigeradas (2 a 8 °C) até 48h. Em temperatura ambiente no caso de amostras em meio conservante (ex. Stuart), hemocultura, cultura anaeróbica ou coprocultura até 48h.